ABSTRAK Nama : Muhammad Irfan Fadhila Program Studi : Sistem Informasi Judul : Performance Analysis of Virtual Machine and Container for Cloud Based High Performance Computing Platform Perkembangan Teknologi Informasi (TI) telah merubah cara pandang kita terhadap dunia saat ini. Salah satu teknologi yang mulai menampakkan diri dan telah menjadi bahan pembicaraan adalah perkembangan cloud computing. Teknologi ini membuka bab baru tentang penggunaan sumber daya TI, dengan menghadirkan konsep as a service. Konsep ini membuat orang bisa menggunakan atau mengakses sumber daya komputasi tanpa harus memilikinya secara langsung. Salah satu pihak yang bisa diuntungkan dari teknologi ini adalah mereka yang berkutat di bidang komputasi kinerja tinggi. Meskipun teknologi ini bisa menjadi solusi bagi mereka yang membutuhkan sumberdaya supercomputer namun tidak memiliki akses ke teknologi semacam ini, masih ada beberapa masalah yang menyebabkan orang-orang di lingkungan komputasi kinerja tinggi enggan untuk menggunakan sumberdaya cloud. Utamanya hal ini dikarenakan oleh fakta bahwa banyak layanan cloud yang dibuat diatas virtual machine, yang mana menghasilkan perbedaan waktu eksekusi yang besar. Untuk itu sebuah platform bernama Docker, sebuah penghasil layanan cloud berbasis linux container, hadir untuk mengatasi masalah ini. Riset ini kemudian berusaha untuk mengidentifikasi dan membuktikan apakah Docker bisa menjadi sebuah platform layanan cloud untuk komputasi kinerja tinggi. Untuk menggambarkan solusi dengan situasi dunia nyata, riset ini menggunakan salah satu perangkat lunak untuk molecular docking, yaitu GROMACS, sebagai studi kasus untuk mendapatkan analisis yang lebih tajam. Hasil yang terlihat menyatakan bahwa Docker terbukti sebagai jawaban atas masalah yang ada melihat kemampuannya untuk menutup perbedaan waktu eksekusi yang dibuat oleh virtual machine dan mencapai tingkat performa mendekati komputer asli. Kata Kunci: cloud computing, komputasi kinerja tinggi, virtual machine, container, Docker, molecular docking, GROMACS.