Indonesia membutuhkan teknologi untuk bisa mengembangkan vaksin dengan cepat. Cara untuk mempercepat proses pengembangan vaksin tersebut adalah dengan memprediksi lokasi epitop konformal dari antigen yang ingin dibuat vaksinnya. Penelitian ini bertujuan untuk mengusulkan metode prediksi epitop konformal berbasis Adaptive Neuro Fuzzy Inference System (ANFIS). Metode yang diusulkan merupakan modifikasi dari metode Discotope yang telah ada sebelumnya. Metode yang diusulkan menggunakan skala kecenderungan epitop dan sifat struktural dari antigen tersebut untuk menentukan lokasi epitop. Hasil penelitian menunjukkan bahwa metode usulan yang berbasis ANFIS memiliki akurasi yang lebih baik dibandingkan metode sebelumnya yang tidak menggunakan fuzzy.