ABSTRAK Nama : Ahmad Ibrahim Program Studi : Ilmu Komputer Judul : Simulasi Dinamika Molekuler dengan Docker Container Menggunakan GROMACS di Atas Multi Node Machine Saat ini performa suatu komputer berperan penting dalam fungsi dan kegunaannya untuk membantu keperluan manusia. Oleh karena itu dikembangkanlah High Performance Computing (HPC). Para ahli di bidang HPC ini mengembangkan berbagai cara untuk mendapatkan komputasi tingkat tinggi. Sampai akhirnya lahir cloud computing, yaitu istilah yang berarti setiap orang dapat mengakses suatu data darimanapun dan kapanpun. Salah satu penerapan dari cloud computing yaitu cluster computing. Cluster computing adalah lingkungan komputasi yang terdiri kumpulan komputer yang saling terhubung oleh suatu jaringan. Cluster computing saat ini sudah banyak dirasakan dampak positif oleh beberapa perusahaan. Namun ada satu kekurangan dari pemakaian cluster computing yaitu pada proses instalasi dan konfigurasi suatu aplikasi harus dilakukan disetiap komputer. Dari masalah inilah tercipta Docker sebagai platform yang dapat membantu produksi instalasi dan konfigurasi dalam satu paket. Docker mampu menjadi solusi dari konfigurasi serta peningkatan performa suatu aplikasi. Salah satu aplikasi yang dapat ditingkatkan dengan Docker adalah GROMACS, yaitu aplikasi simulasi dinamika molekuler. Setelah diuji coba GROMACS mendapatkan performa lebih baik saat menggunakan Docker dan multi node machine. Kata Kunci: HPC, cloud, cluster, Docker, multi node, gromacs, performa.